上了初中之后，阿斯伯格综合症的孩子会遇到一些小学和幼儿园没有遇到的问题。

在初中，随着学习科目变得复杂，自学的内容也增加了。但老师和家长也要求孤独症的孩子根据同龄人的认知成熟度，在学校的执行功能会变得更加明显。

阿斯伯格综合征青少年的执行功能障碍往往表现在组织和计划学校任务、完成课堂作业和家庭作业的能力上。一位患有阿斯伯格综合症的成年人这样描述自己的规划能力：“我走路的时候总是不看路上的坑。”

没有适当的支持，患有孤独症的孩子可能会觉得自己被困在数百万个分散的工作项目中。我们很多人真的不能决定优先事项，没有能力组织任务。

老师可能会抱怨患有阿斯伯格综合征的青少年不能整合自己的行动，并批评他们缺乏组织性。课堂上频繁改变成绩评价或考试的方式，会给他们带来很大的困惑和焦虑。

一些患有阿斯伯格综合征的青少年在以下几个方面存在困难：抽象推理、如何决定事情的优先顺序(以便安排注意顺序)和时间管理，尤其是在给定的任务上需要花费多少时间。这些问题往往会让家长和老师生气，因为他们知道孩子的智力水平应该可以高水平完成任务，但是他们的执行功能缺陷让他们无法及时完成任务，从而受到惩罚。